卵巢巧克力囊肿的病因尚未清楚，但与以人工流产为主的宫腔手术有着密切关系。为了避免更多这样的事情发生，可从采取以下的预防措施：
1、女性注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。
2、女性要注意自身保暖，避免感寒着凉，特别是冬天一定不能只要风度不要温度。
3、在月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。
4、如已查出患有子宫内膜异位症，卵巢巧克力囊肿大于6cm以上者，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累，一旦囊腔内张力突然升高时，囊壁破裂，会形成急腹症。
5、尽量少做人工流产和刮宫，做好计划生育。
6、月经期要做好自身的保健，注意控制自己的情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌的改变。
7、女孩子青春期要避免受惊吓，以免导致闭经可形成溢流。
8、女性月经期一定要禁止性生活。
