卡介苗接种后常见的就是接种部位出现红肿，之后会转化为小脓包，并自行穿破，形成永久性疤痕。前后历时2—3个月，这种属正常反应。
接种卡介苗后有极少数人会出现严重皮疹，紫癜，休克等异常反应，这个时候要及时诊治。
另外，接种中偶尔会发生下列反应：
1、淋巴结炎症：接种后1-2个月左右，颈部、腋下、锁骨上下等淋巴结肿大。反应过强者，淋巴结肿大明显，可形成脓疡或破溃，或在接种处有小脓疤。皮内注射者反应往往较划痕法者强，另外旧结核菌素(OT)试验呈阳性者，接种后也可产生较强反应。
2、类狼疮反应：与结核菌菌株剩余毒力有关。
3、疤痕：因丰富的肉芽组织形成疤痕突起，有时呈疤痕瘤，多见于不作OT试验而直接皮上划痕接种者。这些过程一般会持续2个月。
接种卡介苗后还会常引起接种部位附近的淋巴结肿大（多为腋下淋巴结肿大），这是正常反映，随着接种部位的愈合，肿大淋巴结也会自行消退。可以用热敷的方法促其消退，如果有脓疡形成，可以请医生用注射器将脓液抽出，促进愈合，一般不会对孩子的健康有影响。
