高敬斋逃到临城酒店，发现还是有便衣追着自己。飞虎队商量晚上就可以去干掉走投无路的高敬斋。李正告诉大家，高敬斋是微山湖地区保安司令，现在弃城逃跑，松尾饶不了他。
松尾知道高敬斋逃跑，下命令让高敬斋与飞虎队正面决斗，如果高敬斋要坐火车逃到济南，就封锁临城火车站。
韩贵的下属正在闲聊因为红黑账被飞虎队逼着逃跑的高敬斋，被韩贵听到，韩贵正在训斥他们的时候，二妞带着王强来到炮楼，告诉韩贵的黑点已满，但因为二妞曾为红军做事，韩贵还没到被飞虎队通缉的时候。
高敬斋被日军逼得走投无路，决定折回到沙沟炮楼。韩贵念及高敬斋的救命之恩，决定收留高敬斋。二妞气急告诉韩贵高敬斋对韩贵的救命之恩其实是冲着占自己的便宜。韩贵愤怒，说自己的女人不能脏了身子，让二妞自己离开。
高敬斋在炮楼被刘洪等人包围，就地枪决，摔下炮楼。韩贵高兴地跑回家告诉二妞，却发现二妞已经上吊自杀。飞虎队接到消息，被关押在临城监狱的妇女要被送去南方做日军的慰安妇，其中包括芳林嫂和梅妮。
刘洪等人率领游击队拦截火车，发起进攻，车厢内，梅妮等人率领妇女们跟鬼子拼命，芳林嫂拿着手榴弹威胁猥亵妇女的日军。
危急时刻，田六子冲上车厢救了大家，众人纷纷跳下火车。田六子为了保护梅妮中弹牺牲。刘洪、李正快马驰骋到张司令处，张司令给铁道游击队布置了新的紧急任务，护送一位党中央的“零号首长”平安穿越津浦铁路。
飞虎队众人合计把“零号首长”交给苏鲁支队后，任务就算完成，这次任务需要沙沟炮楼的韩排长配合。韩贵正想将功赎罪，与飞虎队完美配合，王强化妆成伪军，镇守炮楼。
电视剧飞虎队第40集剧情介绍(大结局)护送任务圆满完成。任务结束后，众人才知道他们护送的人正是刘少奇同志，刘少奇说这次他回去要在毛主席面前表扬大家。李正、刘洪都非常激动。
村上接到特务消息，中共和新四军早已打通地下交通线，有一段正好要经过临枣提路线，他嘱咐松尾要加强防守。
飞虎队又接到护送首长的任务，这次的“一号首长”是陈毅同志，刘洪十分高兴。王强跑到沙沟炮楼找韩贵，才知道日军实行换岗制，韩贵已经被换到别的炮楼，新排长二蛋却是王强的老相识，王强做了二蛋的思想工作。
刘洪等人护送一号首长时非常轻松，有吃有笑在炮楼前隐坐等着王强的信号通知。陈毅等人顺利通过，临别前，陈毅赋诗一首表扬铁道游击队的工作。
1945年8月14日日本宣布无条件投降。鞭炮声声响起来，刘洪等人庆祝着战争胜利。接下来，大家身着红军衣服在牺牲兄弟的牌位前脱帽追思。
不久后，国民党来到铁路上，向村上等人下令，必须限期向国民敏政府军队缴械投降。共党首长告诉刘洪等人，国民党公然破坏国共合作，临城警备团一夜之间成了国军，铁道游击队需要端掉临城警备团，迫使临枣地区的日军南下，只要他们经过鲁南，铁路上的戏就该有我们唱了。
这次任务由八路军115师的老六团来协助铁道游击队。但是在这个过程中，驻临枣地区的日军必须保持中立。刘洪独闯龙潭虎穴与日军正式谈判，小林命令松尾严守中立。
八路军和铁道游击队已经层层包围了警备团驻地，接到刘洪发出的信号后向警备团发起进攻。
国民党军再催日军缴械投降，刘洪等人拦截住日军南下的步伐，要求日军必须向八路军缴械投降。以24小时为限，如果日军不投降，八路军将向日军发动总攻。
部队在火车旁篝火野营围困日军，被困在日军火车内的妇女和孩子得到了八路军的食物和水，但小林和松尾的却不能享受到同等待遇。
最终，小林和松尾失去斗志，知道抵抗再无意义，他们决定投降。小林将手中指挥刀高高呈上，承认刘洪等人是自己在中国遇到的最强硬对手。刘洪说，日军真正的对手是千千万万中国人民。
刘洪接过战刀，高呼我们胜利了，中国人民胜利了!八路军指战员们、铁道游击队队员们和老百姓们，高高地举起他们手中各式各样的武器，欢呼着，雀跃着。
